Ваныш-Алпаутово называли Уваныш («Алпаутово тож»), Староалпаутово. Первая часть имени происходит от гидронима - названия реки, вторая - от антропонима. Причем первое название более раннее. Имя Алпаут упоминается в закладной кабале татарина д. Урусаево Казанской дороги Кильмета Байкиева от 17 июля 1707 г., когда он занял у башкира д. Ваныш Алпаута Таишева 5 руб. денег. «А в тех деньгах заложил ему. Алпауту, он, Кильмет, дочь свою, родную девку Гурбару до сроку сентября до 1-го числа нынешнего 707-го году. А буде я... Алпауту на тот вышеписанный срок денег не заплачю и дочери своей Гурбары не выкуплю, и ему, Алпауту, на тое дочь ся закладная кабала и купчая - вольно ему, Алпауту, и жене ево и детям тою моею дочерью владеть вечно и держать у себя во дворе или кому иному переложить. А мне и жене моей и родственникам после того сроку до той дочери дела нет и не зступатца, и о повороте тое дочери на него, Алпауту... великому государю не бить челом и убытков не чинить».
Ранняя история д. Ваныш уходит в XVII в. Однако опубликованные материалы об этом отсутствуют.
В 1816 г. в д. Алпаутово («Ваныш тож») в 18 дворах насчитывалось 294 башкира-вотчинника и 47 тептярей, узаконивших свое пребывание здесь с 1791 г. по договору от 25 мая 1796 г. В начале XIX в. вотчинники д. Каразириково и Алпаутово жаловались на то, что тептяри Кинзягул Тимкин, Тимербай и Башир Алькаевы, Газикай Юзаев, Рахманкул Романов, составляющие 5 дворов, не платили владельцам земли арендную плату в размере 50 коп. с двора в год. После уплаты положенной суммы вотчинники «разрешили тептярям жительствовать на теперешнем месте сроком на 50 лет с платежей оброка по 50 коп. с двора в год».
По VIII ревизии 1834 г. было 430 башкир и 70 тептярей (79 дворов), в 1859 г. - 784 башкира при 128 дворах и 102 тептяря (16 домов), в 1870 г. - 804 башкира (143 двора) и 119 тептярей. Тогда отмечено наличие мечети со школой, 2 мельниц. В 1820 г. в 281 дворе был 1321 башкир и тептярь. В 1834 и 1859 гг. тептяри составляли 11,5 и 12,9 процента всех жителей. Примерно такую же долю они занимали и в 1920 г.
Житель деревни урядник Хисматулла Хасанов сын Юмагулов к 1842 г. 4 раза находился на линейной (Илецкая Защита в 1815 г. Красногорская крепость в 1828 г., Губерлинская крепость в 1831 г.) и на этапной (Пермская губерния в 1818 г.) службе. Его сын - Рахматулла. Башкиры занимались земледелием (на 430 человек в 1842 г. сеяли 1440 пудов озимого и 2720 пудов ярового хлеба, т.е. около 9,7 пуда на каждого; было 3 мельницы), а также животноводством: имели 250 лошадей, 263 коровы, 285 овец, 314 коз; тептяри - 22 лошади, 15 коров, 22 овцы, 28 коз; пчеловодством: башкирам принадлежало 255 ульев и 1422 борти. В 1906 зафиксировано 2 мечети.